En el año 2003 se da a conocer el Informe Final de la Comisión de la Verdad y Reconciliación, que expone la situación general de 69.280 víctimas, sin dar listados con nombres salvo el de casos emblemáticos y autoridades públicas. También se hicieron una serie de recomendaciones en tanto reformas institucionales, reparaciones integrales a víctimas, la puesta en marcha de un plan nacional de Sitios de Entierro y mecanismos de seguimiento a estas recomendaciones.